1.
首批内地指定医疗机构：
香港大学深圳医院：位于深圳市福田区海园一路1号，三级综合医院，公立性质，香港合作试点医院。
广州现代医院：位于广州市天河区沙河濂泉路42号，二级综合医院，港资合资。
广州和睦家医院：位于广州市海珠区琶洲大道31号，二级综合医院，港资合资。
珠海希玛林顺潮眼科医院：位于珠海市香洲区吉大景园路，二级专科医院，港资独资。
中山陈星海医院：位于中山市小榄镇竹源公路18号，三级中西医结合医院，港资合资。
2.
“港澳药械通”第二批指定医疗机构：
中山大学附属第一医院
中山大学孙逸仙纪念医院
南方医科大学南方医院
广东省人民医院
广州市第一人民医院南沙医院
广东祈福医院
广州希玛林顺潮眼科医院
深圳市前海蛇口自贸区医院
深圳禾正医院
深圳希玛林顺潮眼科医院
珠海市人民医院（横琴院区）
佛山复星禅诚医院
东莞松山湖东华医院
东莞光明眼科医院
3.
“港澳药械通”第三批指定医疗机构：
新增指定医院（25家）：
中山大学附属第一（南沙）医院：位于广州市南沙区横沥镇明珠湾起步区横沥岛西侧，三级。
中山大学附属第三医院：位于广州市天河区天河路600号，三级。
中山大学附属第六医院：位于广州市天河区员村二横路26号，三级。
中山大学中山眼科中心：位于广州市越秀区先烈南路54号和天河区金穗路7号，三级。
中山大学肿瘤防治中心：多个地址，三级。
暨南大学附属第一医院：多个地址，三级。
广东省妇幼保健院：多个地址，三级。
广东省中医院：位于广州市越秀区大德路111号，三级。
广州医科大学附属第一医院：多个地址，三级。
广州医科大学附属妇女儿童医疗中心：多个地址，三级。
前海人寿广州总医院：位于广州市增城区新城大道703号，三级。
南方医科大学深圳医院：位于深圳市宝安区新湖路1333号，三级。
深圳市罗湖区人民医院：多个地址，三级。
深圳市宝安区妇幼保健院：位于深圳市宝安区新安街道玉律路56号，三级。
深圳新风和睦家医院：位于深圳市福田区沙头街道新洲社区福强路4012号新风大厦，二级。
深圳恒生医院：位于深圳市宝安区西乡街道银田路20号，三级。
北京大学深圳医院：位于深圳市福田区莲花路1120号，三级。
中山大学附属第五医院：位于珠海市香洲区梅华东路52号，三级。
佛山希玛林顺潮眼科医院：位于佛山市禅城区绿景一路13号，二级管理。
惠州市第三人民医院：位于惠州市惠城区桥东学背街1号，三级。
惠州希玛林顺潮眼科医院：位于惠州市惠阳区淡水桥背规划小区B4号，二级管理。
东莞东华医院：多个地址，三级。
中山市人民医院：多个地址，三级。
江门市中心医院：位于江门市北街海傍街23号，三级。
肇庆正大国健康复医院：位于肇庆市鼎湖区肇庆新区站前大道10号，三级。
指定医院资质变更（4家）：
广州市第一人民医院：多个地址，三级，包含原广州市第一人民医院南沙医院。
珠海市人民医院：多个地址，三级，原珠海市人民医院中横琴院区已划出。
中山陈星海中西医结合医院：位于中山市小榄镇竹源公路18号，三级，原中山陈星海医院变更。
广州医科大学附属第一医院横琴医院：位于横琴粤澳深度合作区宝兴路118号，三级，原珠海市人民医院横琴院区新设置变更为该医院